drunk.codes

xenobiochemie

Transport

Membránové transportéry

Transportéry xenobiotik - SLC, ABC - Epiteliiální tkáně - enterocyty - influxní transportér - apikální strana - eflux - basolaterální

SLC - Hlavně influxní - 500 cca

SLC21 - Endogenné - org anionty, prostaglandiny, žluč kys - Antibiotika ,,, SLC22A
- 25 členů - Org kationty - kys močová - Transport xenobiotik - antibiotika, antivirotika, protinádorová léčiva - cisplatin SlC47A - 2 členy - Xenobiotika - TEA, MPP, oxalilplatina, guanidin, procainamid Mutace slc - Hladina bilirubinu, Crohn, účinnost léčiv

ABC
- = atp binding casette - Velé proteiny - 140 - 180 kDa - Transmembránové domény - 1 - 2 - NBD - nucleotide binding - atp ABCA - 12 - Transport cholesterolu, lipidů - Zrak - vit A
ABCB - ABCB1 (MDR1) = P-glykoprotein - široká specifita - různá xenobiotiak - -> léková resistence ABCC
- resistence - Abbc7 = CFTR - cystická fibróza - Cl- kanál

ABCG - Xenobiotika,toxiny,resistence

Mnohočetná léková resistence - Aktivvita transportérů, metabolismus,n - Role AABCB1. ABCC1, ABCC2, ABCG2

Praktické stanovení profilu membránových transportérů - Na úrovni - genu, proteinu, epigeneteiky, funkce - exprese - mrna, rtpcr ... - RNAseq -genetika - DNA seq, rt pcr

Digitální PCR - Podobné rt pcr - Rozdělení vzorku na mnoho čipů/ kapek - vysoce citlivá - Využití - kvantifikace dna, rna, patogenní na, tekuté biopsie = detekce nádorové dna

Farmakogenomické ttestování -